A. ①については卒業生組織部門のディレクトリの公開設定で「 表示できるユーザーなし」を選択することで可能となります。
②については、組織部門全体のディレクトリ公開設定を「表示できるユーザーなし」にして、在校生と卒業生それぞれの組織部門で「カスタムディレクトリ設定」を選択して表示範囲を制限することで可能かと思います。
事前に検証用組織部門を作成して表示内容をご確認ください。
下記ヘルプトピックもご参照ください。
ディレクトリ検索結果に表示されるユーザーを制御する
https://support.google.com/a/answer/9401094?hl=ja